Pregunta más frecuente

Visualización de ficheros de scratch para trabajos en Lusitania II
Últimas actualizaciones hace 2 años

Debido al uso intensivo del almacenamiento que realiza Gaussian, los nodos de Lusitania II (cola lusitania) realizan el scratch en unos discos no visibles directamente por el usuario, es por ello que, es necesario utilizar unos comandos especiales para la visualización de estos ficheros.

Los siguientes comandos se encuentran disponibles en el sistema:

  • scratch-ls: permite el listado de los ficheros de cada trabajo (como el comando ls)
  • scratch-cat: permite mostrar en la pantalla el contenido de un fichero (como el comando cat)
  • scratch-tail: permite mostrar las ultimas líneas de un fichero (como el comando tail)

NOTA: puede ver la ayuda de cada comando ejecutándolo con el parámetro "--help".

Cada comando anteriormente listado, permite el uso de varios parámetros para configurar su uso tal y como sucede con los comandos tradicionales equivalentes. Se puede mostrar ayuda de cada comando ejecutándolo con el parámetro "--help".

A cada uno de estos comandos, se le debe indicar el JOBID del trabajo para el que va a ejecutarse. Ejemplo de uso:

Para mostrar los JOBIDs disponibles:

$ scratch-ls
JOBID
590421
590420
590419

Para ver los ficheros del trabajo 590420:

$ scratch-ls 590420
Gau-20646.inp
Gau-20646.d2e
Gau-20646.int
Calculo.log
...

Para mostrar el contenido del fichero se puede usar scratch-cat o scratch-tail, indicando el JOBID y el fichero a leer.

$ scratch-tail -n3 590420 Gau-20646.inp
D 53 22 24 25 S 18 15.000000
D 7 8 10 12 S 18 15.000000


NOTA: si el trabajo no hace uso de scratch, indicara que se ha seleccionado un JOBID erróneo.

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